Ένα νέο αντίγραφο του bootsect.lnx πρέπει να μεταφερθεί στο C:\BOOTSECT.LNX
κάθε φορά που ο bootsector της κατάτμησης linux τροποποιείται.
Αυτό συμβαίνει για παράδειγμα όταν εγκαθιστάτε ένα νέο πυρήνα με το lilo.
Όπως μπορείτε να δείτε, ένα τέτοιο σύστημα δεν είναι ιδανικό για τεστάρισμα πειραματικών πυρήνων.